جهت ارزیابی، طراحی و انجام پروژه داکینگ مولکولی با بالاترین دقت، لطفاً اطلاعات زیر را در اختیار ما قرار دهید:
تعداد لیگاندها
تعداد آمینواسیدهای پروتئین
تعداد اتمهای هر لیگاند
آیا جایگاه اتصال پروتئین مشخص است؟
در صورتی که محل اتصال مشخص نباشد، زمان تحلیل و دقت محاسبات تحت تأثیر قرار میگیرد و نیاز به جستجوی گستردهتری خواهد بود.
برای شروع پروژه، ارسال فایلهای زیر ضروری است:
فایل PDB پروتئین
فایل لیگاند در فرمت PDB یا MOL2
پس از پایان داکینگ، خروجیها به شکل استاندارد علمی ارائه میشوند:
جدول Binding Energy برای تمام کانفورماسیونها
فایل کمپلکس پروتئین–لیگاند شامل تمام Poseها با فرمت قابل استفاده در نرمافزارهای ساختاری