​​شرایط طراحی پپتید با روش de novo

جهت ارزیابی، طراحی و انجام پروژه طراحی پپتید به روش de novo با بالاترین دقت، لطفاً اطلاعات زیر را در اختیار ما قرار دهید:
- توالی یا فایل ساختاری پروتئین هدف
- طول پپتید مورد نظر
- تعداد پپتیدهای طراحی‌شده مورد نیاز
- آیا جایگاه اتصال یا ناحیه هدف روی پروتئین مشخص است؟
- آیا آمینواسیدهای کلیدی برای اتصال مشخص هستند؟
- آیا محدودیت خاصی برای توالی پپتید وجود دارد؟

در صورتی که جایگاه اتصال یا آمینواسیدهای کلیدی مشخص نباشند، زمان تحلیل و دقت طراحی تحت تأثیر قرار می‌گیرد و نیاز به جستجوی گسترده‌تری برای شناسایی بهترین ناحیه اتصال خواهد بود.

برای شروع پروژه، ارسال فایل‌های زیر ضروری است:
- فایل PDB پروتئین هدف
- در صورت وجود، اطلاعات مربوط به جایگاه اتصال یا Hotspot residues
- در صورت وجود، توالی یا ساختار پپتیدهای مرجع یا مشابه

پس از پایان طراحی، خروجی‌ها به شکل استاندارد علمی ارائه می‌شوند:
- لیست پپتیدهای طراحی‌شده به همراه توالی آن‌ها
- فایل‌های ساختاری قابل استفاده در نرم‌افزارهای مولکولی